Büyük Menderes Nehri, Söke Ovası'nın ekosisteminde önemli bir rol oynamaktadır. Bu nehir, bölgedeki tarım faaliyetlerini destekleyen verimli alüvyonları taşımasının yanı sıra, zaman zaman meydana gelen taşkınlarla da yerleşim alanlarını tehdit edebilmektedir. Nehrin getirdiği su, tarımsal üretimi artırırken, kirlilik sorunları da beraberinde getirmektedir. Bu dengenin sağlanması, bölgenin geleceği açısından kritik bir öneme sahiptir.

Büyük Menderes Nehri'nin Söke Ovası üzerindeki etkileri şunlardır:

• Tarım: Söke Ovası, Büyük Menderes Nehri sayesinde canlanır ve bu ova, Türkiye'nin en önemli tarım merkezlerinden biridir.
• Taşkınlar: Yoğun yağışların olduğu yıllarda nehir taşarak Söke Ovası'nı sular altında bırakır, bu durum binlerce hektar tarım arazisinin ve çevredeki yerleşim yerlerinin sular altında kalmasına neden olur.
• Kirlilik: Nehrin kirlenmesi, ovada sulanan tarım ürünlerinde kirlilik oluşmasına yol açar.
• Tarihsel Dönüşüm: Büyük Menderes'in taşıdığı alüvyonlar, Söke Ovası'nın oluşmasına katkıda bulunmuş, ancak bu süreçte deniz giderek çekilmiş ve Latmos Körfezi dolarak Bafa Gölü'nün oluşmasına neden olmuştur.